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1、因企业硬盘损坏等原因造成软盘中税控发票存根联份数小于税控IC卡中份数的，企业应提供当月全部税控发票存根联，到主管税务所通过认证子系统进行扫描补录。
2 、因企业更换金税卡等原因造成软盘中税控发票存根联份数大于税控IC卡(不含税控IC卡为零的情况)中份数的，其软盘中所含税控发票存根联明细数据可读入报税子系统，但当月必须查明产生此种不一致情况的原因。
3、因企业计算机型号不匹配造成税控IC卡中税控发票存根联数据为零的，根据系统提示可以存入的，将软盘数据存入报税系统;根据系统提示不能存入的，企业应持当月全部税控发票存根联到主管税务所通过认证子系统进行扫描补录。
4、因企业软盘质量问题致使无法采集税控发票存根联数据的，企业应重新报送软盘。